防控猪球虫病，首先要有科学的管理方式及严格的卫生制度，例如母猪进产房前，对产房彻底清刷、消毒，保持产房清洁，防止仔猪接触母猪粪便。控制猪场蚊蝇，切断传播途径。其次是药物防控，例如仔猪出生3～5天，灌服妥曲珠利。

　　猪结肠小袋纤毛虫是一种常在的、条件性致病寄生虫，一般情况下为共生。根据经验，如果猪只拉稀，同时粪检中查到大量的能运动的滋养体，说明此时结肠小袋纤毛虫正处在致病时期，需要投药进行治疗。如果猪只粪便正常，粪检中只查到包囊期虫体，此时结肠小袋纤毛虫处在非致病的共生时期，不需要投药治疗。

　　弓形虫感染途径多且复杂，要注意生物防控，防止猫及其排泄物污染环境，做好灭鼠、蟑螂、蝇等工作。圈舍保持清洁，定期消毒;流产胎儿、可疑病尸等严格处理。治疗主要应用磺胺药及抗菌增效剂，但要控制好此病，应掌握该病在猪群的流行动态很重要。

　　种猪场可应用“4+1”驱虫模式，即针对寄生虫生活史在种猪群进行一年四次的驱虫。保育猪在50-60天龄驱虫1次，引进猪并群前驱虫1次。

　　种猪场防控内寄生虫要长期坚持控制感染，最终逐步净化猪场的寄生虫，提高猪场经济效益。